此时这方世界正是清晨，空气中有薄薄的雾，让整个天地一片朦胧，只能隐隐约约的看到远方的大海上，似乎趴着一座庞然大物。
张恒略微沉思，突然脚下轻轻一台，顿时整个身躯都轻盈的朝天空中升去，离开地平线之后，一轮暗红色的太阳跟着张恒从天边升起，冲散了浓厚的晨雾，可是在阳光照射到海上的时候，张恒却突然瞳孔一缩！
他竟然看到，在不知多少公里之外的远方，半颗如同巨山的头颅正横跨在海面！
这颗头颅早已腐烂，皮肤变成了黑褐色，坑坑洼洼，还未彻底消融的肌肉组织就那样耷拉在脸颊上，一颗眼睛早已爆开，化作幽深的黑洞。
这颗头颅不知道已经死去了多久，可是因为太过巨大的原因，直至今日都没有彻底腐烂风化，即使是喜马拉雅山在其面前，也如同小儿科一般！
甚至，在头颅更加远的远方，还能看到一具和头颅同等大小的身躯，这具身躯的大小，几乎占据了一个大洲的面积！
这具尸体，便是人类之母莉莉丝了，或者说是和三无女神绫波丽合体后的莉莉丝。
《新世纪福音战士》所讲述的，并非是传统基督教的圣经，反而更为接近犹太教的教义，按照犹太经文所说，莉莉丝和撒旦的孩子才是现在的“人类”，而经书上原本的正牌“人类”（亚当的子孙）已经被我们杀灭取代，我们不止取代了人类的地位，还偷取了其历史“出身”，自称人类繁衍至今。
而《新世纪福音战士》的剧情，便是围绕着人类和亚当使徒的战斗而来。
似乎是生命之树在降生了亚当和莉莉丝之后，因为能量涨落现象，最终生成了十七枚生命果实，于是人类作为第十八使徒，只能获得作为替代的智慧果实。
因为没有获得强大的生命力量，人类最终只能分裂成为一个个个体，各奔前程，可是祸兮福所倚，无数年之后，人类反而凭借智慧发展出高度发达的文明，并以世界的主人自居。然而却也因为智慧之果产生了“心之壁”，使人与人之间产生隔阂，心灵中充满冷漠与悲哀。
最终，孤寂感迫使某些人类开始寻找新的生存之道。
在剧情中，人类首先发现了死海文书，然后得知了远古的秘密，随即在发现亚当的尸体后引发第二次冲击，之后不断进攻人类的使徒，就是第一使徒——亚当的化身。最终人类倾尽全力消灭了所有使徒，然后由人类背后最为秘密组织Seele启动了企图让全世界人类回归母体莉莉丝体内、除心之壁，最终成神的计划！
这个计划，就是大名鼎鼎的‘人类补全’计划！
圣经有云，当一个生命同时吃下‘生命之果’和‘智慧之果’的时候，他的力量便足以接近神灵。而动画中所谓的生命之果，便是使徒那无限能源的能力了，而所谓智慧之果，则代表了人类发达的文明。人类在杀死使徒之后，已经获得了生命之果，再加上本身拥有的智慧之果，再加上亚当和莉莉丝的灵魂，终于拥有了补全的力量。
至于动画最终的结尾，则有两个版本，一个是计划成功，一个计划失败，这里无需过多叙述，反正这座位面作为次元之星的选择名单，肯定是人类灭亡的世界了。